갑상선기능저하증의 원인에 따라 다릅니다.

때론 일시적으로 기능저하를 일으키는 질환과 하시모토 갑상선염의 구별이 어려운 경우 갑상선호르몬제 투여후 6~12개월에 약을 중지하고 정상 기능으로 회복되었는지를 보기도 합니다.

심지어 하시모토 갑상선염의 일부 중에서도 약을 중지한 후 정상 기능이 유지되는 경우가 있습니다.

그러나 갑상선을 파괴하는 치료(수술, 방사성요오드 치료)를 받은 후에 발생할 기능저하인 경우에는 정상으로 회복될 가능성이 거의 없습니다.