하시모토 갑상선염은 자가면역성 갑상선 질환으로 유전적 감수성이 높은 경우에 잘 발생하므로 부모 중 한쪽 또는 양쪽이 질환을 가진 경우 자녀에게서도 발생할 확률이 높아지는 것은 사실입니다.

자가항체 검사를 기준으로 하면 부모가 모두 병이 없는 경우에 비하여 한쪽 부모가 질환을 가진 경우 자녀가 이 병에 걸릴 확률은 약 2~3배 증가하는 것으로 추정됩니다. 이는 부모 중 당뇨병이 있는 경우 후에 자녀에서 당뇨병 발생의 위험이 높은 것과 같은 이치입니다.

하지만 부모 중 하시모토 갑상선염이 있다고 하여 자녀에게서도 꼭 이 병이 발생하는 것은 아닙니다. 하시모토 갑상선염은 발견만 하면 치료는 아주 용이하므로 부모가 이 병이 있다고 해서 자녀에게 발병할 것을 두려워하여 출산을 기피할 필요는 없습니다.

또한 이 병은 주로 성인 이후에 발병하는 것이므로 영·유아기에 이 질환으로 문제가 되는 경우는 극히 드뭅니다.