정상인의 경우에도 20% 정도는 두통을 호소합니다.
루푸스에 특이한 두통이 있는지에 대해 학자에 따라 논란이 있습니다만 중요한 것은 감염, 뇌졸증, 종양, 약물로 인한 경우를 감별하는 것이고 심한 두통의 경우는 뇌 컴퓨터 촬영이나 MRI, 뇌 척수액 검사, 혈액 응고 검사 등이 필요합니다. 편두통처럼 오는 경우 활동성 루푸스의 징조일 수 있습니다.
치료는 그 심한 정도에 따라 다르며 스트레스 관리나 정신적 지지가 필요하며 진통제나 소량의 스테로이드, 때에 따라서는 삼환계 항우울제나 항베타 차단제를 사용하기도 합니다.