지사제로 비스므스제재가 많이 사용되고 있습니다. 빠른 효과를 기대하면 로페라마이드나 로모틸 같은 약이 좋습니다. 그러나 열이 있거나 피가 나오는 세균성 설사의 경우에 지사제를 너무 과용하면 병의 경과를 길게 하거나 악화시킬 수 있으므로 조심해야 합니다.
항생제는 원인균이 발견되거나 임상적으로 세균성 설사가 강력히 의심될 때 사용할 수 있습니다. 대장균, 이질균, 살모넬라균, 캠피로박터균, 에르시니아균 등이 검출되면 시프로플록사신, 암피시린, 박트림 등이 추천됩니다. 만약 아메바가 검출되면 메트로니다졸이 특효약입니다.