크게 흡인성 폐렴과 요로 감염이 있습니다. 뇌졸중 환자 중 연하 곤란(삼키기 어려운 증상)이 있는 환자들은 목구멍, 혀의 근육이 약하므로 입안의 음식물이나 침이 기도를 통해 폐로 넘어갈 수 있는데 이것이 흡인성 폐렴의 원인이 됩니다. 흡인성 폐렴이 생기면 열이 나고 가래가 증가하며 때론 가래가 너무 많아 기도를 통한 산소의 흡입을 방해하기도 합니다. 그리고 많은 뇌졸중 환자들이 급성기 뇌졸중 시기에 소변을 볼 수 없어서 소변줄을 끼고 있는데, 이런 소변줄을 통해 세균 등이 침입할 수 있어 요로 감염이 흔히 생깁니다. 요로 감염은 열이 나고 소변에 백혈구가 많아지는 것으로 진단을 내릴 수 있습니다. 환자는 신체 기능이 약하여 저항성이 떨어져 있는 상태이며 병원은 여러가지 병균이 많은 곳이기 때문에 의료진이 각별히 주의를 하여도 이러한 감염은 병원내에서 자주 발생합니다. 이러한 감염은 때론 뇌졸중 후 사망의 직접적인 원인이 되기도 합니다.