신경모세포종의 예후는 환자의 연령과 병의 단계에 따라 많은 차이가 납니다. 즉, 1세 미만 영아에게는 1세 이상의 소아에 비해 같은 단계라도 좋은 생존율을 나타냅니다.

영아에게서 낮은 단계는 생존율이 90% 이상이 되며, 전이가 있는 군에서도 장기 생존율이 50% 이상이 됩니다. 1세 이상 소아에게도 낮은 단계에서는 좋은 예후를 나타냅니다.

그러나 나이가 많고 전이가 광범위할수록 예후가 좋지 않아서 강력한 치료를 하더라도 생존율이 20%를 넘기가 힘듭니다.

그 외 예후 인자로서 N-myc 유전자 수, 조직 소견, NSE, ferritin, LDH 등의 종양 표지자(tumor marker) 증가 정도가 관계되며, 같은 단계와 연령에서도 N-myc 유전자 수가 많거나 예후 불량한 조직 소견이 있거나 상기한 종양 표지자의 증가가 있는 경우는 그렇지 않은 경우보다 예후가 불량합니다.