하시모토 갑상선염은 자가면역 질환으로 일반적으로 출산 후에 악화되는 경향이 있습니다. 임신중에는 정상적으로 면역체계(immune system)의 활동이 억제됩니다. 면역체계는 자신의 세포가 아닌 외부세포를 공격하는 우리 몸의 파수꾼인데 태아(fetus)도 일종의 외부세포이므로 면역 체계가 정상적으로 작동하는 상태에서는 태아세포들이 공격 받을 수 있겠지요.

따라서 임신중에는 태아를 안전하게 보호하기 위하여 면역체계 활동이 정상적으로 억제되고, 출산 후에는 억제되었던 활동이 비정상적으로 매우 증가할 수 있습니다.

따라서, 자가면역 질환의 일종인 하시모토 갑상선염은 면역체계 활동이 정상적으로 억제되는 임신기간 동안에는 호전되는 경향이 있고, 면역체계의 활동이 비정상적으로 증가될 수 있는 출산 후에는 악화될 수 있습니다.