소아에서 비부비동염의 치료는 우선 약물치료이며 대부분의 경우는 약물치료에 잘 반응합니다. 보통은 2주 정도의 약물 치료로 증상이 호전되며 그 후에도 증상이 계속되거나 재발한 경우에는 적어도 3주 이상의 약물치료가 필요합니다.

일반적으로 소아에게 사용하는 약물들은 장기간 사용하여도 부작용은 크게 염려하지 않아도 됩니다. 일부에서는 장기간 사용 시 부작용이 생길 수도 있는 약이 있으나 그러한 약들은 병원에서 오래 사용하지는 않기 때문에 담당 의사와 상의하여 쓴다면 문제는 없을 것입니다.

소아에서 비부비동염의 수술적 치료는 안면 골의 발육에 영향을 줄 수 있습니다. 그렇기 때문에 안면 골의 발달이 충분히 이루어지는 사춘기 이전에는 비교적 제한된 경우에 한해 시행하며 특히 점막을 최대한 보존해야 합니다.

부비동염으로 인해 합병증이 생겼을 때나 충분한 약물치료에도 불구하고 증상의 호전이 전혀 없는 경우에는 수술적인 치료가 적용이 될 수 있으나 성인에서와 같은 수술이 아니라 최소한의 수술을 통해 부비동에 찬 농의 배설을 도와줄 목적으로 시행할 수 있습니다.